Geleneksel optik veya elektron mikroskopisi bir numune yüzeyinin
veya ince dilimlerin iki boyutlu görüntülerini göstermeye
yardımcı olur. Ancak, çoğu durumda orijinal üç boyutlu nesne
yapıları hakkında bir sonuç iki boyut bilgisine dayanarak
çıkartılamaz.
Nesne yapılarının üç boyutlu bilgileri, onları ışık mikroskobunda
görüntülenebilecek çok ince dilimlere bölüp iki boyutlu bilgileri
üç boyutlu bir yapı modeline birleştirerek elde edilebilir.
Ancak bu yöntem sadece kullanışsız değil aynı zamanda nesnenin
kendisi hazırlama tekniği ile değiştirilebileceğinden ve dilimler
arasındaki uzaklık 3D bilgisinin kaybolmasından kaçınmak için
genellikle fazla kaba olduğundan çok güvenilir değildir.
Bir Röntgen (radyografi) sistemi bütün üç boyutlu dâhili yapıların
iki boyutlu gölge görüntülerini üretir ama tek bir iki boyutlu
gölge projeksiyonda derinlik bilgisi tamamen karışır. Sadece
bir Röntgen tomografi sistemi örnek hazırlama veya kimyasal
sabitleme olmadan üç boyutlu nesne yapılarını görüntülememizi
ve ölçmemizi sağlar. Tipik olarak, geleneksel tıbbi CT-tarayıcıların
uzaysal çözünürlüğü 1–2. mm.dir ki bu 1–10 mm3 voksel (hacim
elemanı) boyutuna denk gelir.
Bilgisayarlı Röntgen mikroskopisi ve mikrotomografi şimdi
uzaysal çözünürlüğü hacim terimleri ile yedi ila sekiz derece
geliştirme olanağı sunmaktadır. “SkyScan 1174” neredeyse 1x10–6
mm3 voksel boyutuna denk gelen 10 ?m.den daha küçük bir uzaysal
çözünürlüğe ulaşmaya izin vermektedir. “Makro” CT-tarayıcılarda
olduğu gibi, dâhili yapı tamamen bozulma olmadan yeniden oluşturulup
analiz edilebilir.